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基础兽医学包含了家畜解剖学、家畜组织学与胚胎学、动物生理学、兽医药理学与毒理学、兽医病理学等三级学科，为基础兽医学博士学位与硕士学位授予点。目前已形成七个稳定的研究方向。从分子、细胞、组织和整体不同层次，研究动物的形态结构、生长发育规律、新陈代谢活动、疾病发生及药物作用机理的学科。该学科现有博士生导师5名、硕士导师11名，其中教授5名、副教授8名、讲师7名，12人具有博士学位。近5年来，承担省部级以上科研项目30余项，获省部级科技奖励10余项，在国内外重要学术刊物上发表论文300余篇，形成了一支实力雄厚的研究生培养队伍。在动物发育及比较组织学、兽医病理、新兽药开发和毒理评价、水生动物疫病致病机理、环境公害及中毒病研究等方面取得了一系列科研成果。